TCA cycle
이론과 하이라이트 히스토리를 확인 할 수 있어요.
TCA 회로의 각 과정을 알고 있는 것이 중요하다. 특히 TCA 회로의 대체 경로, 암세포에서 발생하는 Warburg effect에 관한 문제가 주로 제된다.
1. 피루브산 → 아세틸-CoA
1) 효소: PDH complex (pyruvate dehydrogenase complex)
2) 조건: 산소 O, 미토콘드리아 O
3) 장소: 세포질에서 생성된 피루브산이 미토콘드리아 기질에서 아세틸-CoA로 변환
4) PDH complex 조절
(1) 아세틸-CoA
① 아세틸-CoA의 feedback inhibition (negative allosteric regulation)
② 아세틸-CoA → PDK(PDH kinase)↑ → PDH complex 인산화 → PDH complex↓
(2) [ATP]/[ADP]↑ → PDH complex↓ (negative allosteric regulation)
(3) [NADH]/[NAD+]↑ → PDH complex↓ (negative allosteric regulation)
5) 아세틸-CoA
(1) 기원
① 글리코겐 → 글리코겐 분해 → 해당과정 → 산화
• 글리코겐 → 포도당 → 피루브산 → 아세틸-CoA
② 트리글리세리드 → 지방 분해 → β 산화
• 트리글리세리드 → 유리지방산 → 아세틸-CoA
• 아세틸-CoA 농도 증가 ≒ β 산화 증가
③ 단백질 → 단백질 분해 → Deamination & Oxidation
• 단백질 → 아미노산 → 아세틸-CoA
(2) 행로
① TCA cycle
• 상황: 정상
• 효소: citrate synthase
② 케톤체 합성
• 상황: 금식; OAA와 만나 citrate가 합성되며 TCA cycle로 진행되어야 하는데, OAA가 포도당신생합성에 이용되며 고갈되어 TCA cycle로 들어가지 못함
• 효소: HMG-CoA synthase
③ 지방산 합성
• 상황: 잉여 포도당 과다
• 효소: ACC, ACL, FAS
2. TCA 회로
1) 장소: 미토콘드리아 기질
2) 과정
① Pyruvate → Acetyl-CoA (PDH complex) ② Acetyl-CoA + OAA(Oxaloacetate) → Citrate (citrate synthase) ③ Citrate → Isocitrate (aconitase) ④ Isocitate → α-KG(α-Ketoglutarate): NADH+H+ 생성 (isocitrate dehydrogenase) ⑤ α-KG → Succinyl-CoA: NADH+H+ 생성 (α-ketoglutarate dehydrogenase complex) ⑥ Succinyl-CoA → Succinate: GTP 생성 (succinyl-CoA synthetase) ⑦ Succinate → Fumarate: FADH2 생성 (succinate dehydrogenase) ⑧ Fumarate → Malate (fumarase) ⑨ Malate → OAA: NADH+H+ 생성 (L-malate dehydrogenase) |
3) 결과: GTP 생성 → 이후 ATP로 변환
4) 포도당 1분자의 충분한 산화(해당과정 + TCA cycle) 결과
반응 | ATP, NADH, FADH2 | 궁극적 ATP 생산량 |
Glucose → glucose6-phosphate | −1ATP | -1 |
Fructose6-phosphate → fructose1,6-bisphosphate | −1ATP | -1 |
2 Glyceraldehyde3-phosphate → 2 1,3-bisphosphoglycerate | 2 NADH | 3 or 5 (*) |
2 1,3-Bisphosphoglycerate → 2 3-phosphoglycerate | 2 ATP | 2 |
2 Phosphoenolpyruvate → 2 pyruvate | 2 ATP | 2 |
2 Pyruvate → 2 acetyl-CoA | 2 NADH | 5 |
2 Isocitrate → 2 α-ketoglutarate | 2 NADH | 5 |
2 α-Ketoglutarate → 2 succinyl-CoA | 2 NADH | 5 |
2 Succinyl-CoA → 2 succinate | 2 ATP (or 2 GTP) | 2 |
2 Succinate → 2 fumarate | 2 FADH2 | 3 |
2 Malate → 2 oxaloacetate | 2 NADH | 5 |
Total | 30-32 |
• NADH: 2.5 ATP, FADH2: 1.5 ATP
(*) Malate-Aspartate shuttle을 통해 그대로 들어오는 경우 5 ATP, Glycerol 3-phosphate shuttle을 통해 FADH2로 들어오는 경우 3 ATP
5) 의의: 해당과정만으로는 2ATP 생산 → TCA cycle 통해 30~32 ATP까지 생산 가능
6) 조절
| (1) Pyruvate → Acetyl-CoA (+) AMP, CoA, NAD+, Ca2+ (-) ATP, acetyl-CoA, NADH, fatty acids (2) Acetyl-CoA → Citrate (+) ADP (-) NADH, succinyl-CoA, citrate, ATP (3) Isocitrate → α-KG (+) Ca2+, ADP (-) ATP (4) α-KG → Succinyl-CoA (+) Ca2+ (-) succinyl-CoA, NADH |
3. TCA cycle의 대체 경로
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