저도 궁금해서 찾아봤는데 특별자치도지사가 한 급이 내려온게 아니라, 특별자치도의 특성상 그 아래의 시장,군수,구청장 급이 없기 때문이라고 합니다.

그래서 관할보건소장이 시장,군수에게 보고하고 이들이 도지사에게 보고하는 체계가 아니라, 관할보건소장이 특별자치도지사에게 곧바로 보고하는 체계라고하네요. 즉, 특별자치도지사가 2단계와 3단계를 아우르고 있다고 이해하면 된다고해요.

예를 들어, 제주특별자치도에는 서귀포시장과 제주시장이라는 직책이 존재하기는 하지만, 이들은 다른 시군구청장과는 다르게 선출직이 아니라 제주특별자치도지사의 임명직이기 때문에 다른 시군구청장과는 다르게 감염병 관리에서 법적 책임을 질 수 없는 자리라고 합니다. 그래서 보건소장의 직속 상관이 서귀포시장이나 제주시장이 아니라 제주특별자치도지사가 되기 때문에 보고가 특별자치도지사에게 가는 구조라고 이해하시면 될거같아요.